DNA BARCODING DURIAN LOKAL SULAWESI TENGAH MENGGUNAKAN LOKUS trnC(GCA)-petN DAN psaA-ycf3

Durian (Durio zibethinus) merupakan buah tropis yang memiliki keragaman genetik
tinggi, termasuk pada durian lokal Sulawesi Tengah. Penelitian ini bertujuan
menganalisis potensi lokus trnC(GCA)-petN dan psaA-ycf3 dalam membedakan
spesies pada genus Durio serta variasi genetik durian lokal Sulawesi Tengah.
Penelitian dilakukan menggunakan pendekatan in silico dan analisis hasil perunutan
DNA melalui BLASTN, alignment sekuens, analisis substitusi dan indel, serta
rekonstruksi pohon filogenetik. Hasil analisis in silico menunjukkan bahwa lokus
psaA-ycf3 mampu membedakan spesies pada genus Durio, sedangkan lokus
trnC(GCA)-petN hanya menunjukkan perbedaan yang jelas pada D. testudinarius.
Hasil perunutan DNA menunjukkan bahwa lokus psaA-ycf3 mampu membedakan
variasi genetik antar genotipe durian lokal Sulawesi Tengah, sedangkan lokus
trnC(GCA)-petN belum menunjukkan perbedaan yang signifikan. Dengan demikian,
lokus psaA-ycf3 berpotensi digunakan sebagai penanda molekuler untuk identifikasi
spesies dan analisis variasi genetik pada genus Durio.
Kata kunci: DNA barcoding, Durio zibethinus, keragaman genetik, trnC(GCA)-
petN, psaA-ycf3