ANALISIS IN SILICO STRUKTUR TIGA DIMENSI PROTEIN STRUKTURAL VP1 PADA ENTEROVIRUS A71 DAN PEMANFAATANNYA SEBAGAI SUMBER BELAJAR

ABSTRAK

Suprianto, 2019. Analisis In Silico Struktur Tiga Dimensi Protein Struktural VP1
pada Enterovirus A71 dan Pemanfaatannya sebagai Sumber Belajar. Skripsi.
Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan MIPA, Fakultas Keguruan
Dan Ilmu Pendidikan, Universitas Tadulako. Pembimbing I Made Budiarsa.

Protein struktural VP1 berperan sebagai pemain kunci dalam patogenesis,
memiliki keunikan yang cukup menarik untuk dikaji dengan mempelajari sifat dan
fungsi protein struktural VP1. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi struktur
tiga dimensi protein VP1 pada EV-A71. Protein target diperoleh dari server
UniProt dengan kode akses A0A097EV89 menggunakan template 4cey.1.A (PDB
ID) dianalisis secara in silico melalui metode homologi menggunakan server
Swiss Model. Hasil analisis menunjukkan protein target dan template memiliki
identity 95,29 ?n tersusun dari 297 asam amino dengan nilai QMEAN -2,15.
Protein struktural VP1 pada Ramachandran Plots memiliki struktur stabil, residu
non-glisin pada daerah outliers hanya berkisar 0,34 % (A53 ALA) dengan Nilai
rotamer outliers 1,61 %. Hasil penelitian yang dibuat dalam bentuk modul layak
digunakan sebagai sumber belajar.


Kata Kunci : protein VP1, EV-A71, swiss model, metode homologi, in silico