ANALISIS IN-SILICO PROTEIN HIGH AFFINITY NEUROTROPHIN 3 RECEPTOR PADA Gallus Gallus (Chicken) DAN PEMANFAATANNYA SEBAGAI SUMBER BELAJAR

Muhammad Fathur Rahman, 2019. Analisis In-Silico Protein High Affinity
Neurotrophin 3 Reseptor pada Gallus gallus (Chicken) dan Pemanfaatannya sebagai
Sumber Belajar. Skripsi, Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan,
Universitas Tadulako. Pembimbing I Made Budiarsa.

Protein NT3 diekspresikan oleh Neurotrophin 3 (NTF-3) berperan dalam
proses diferensiasi, kelangsungan hidup neuron perifer dan neuropatologis. Protein
NT3 dapat mengikat Trk A, Trk B dan Trk C. Penelitian bertujuan memprediksi
struktur tiga dimensi protein Trk A dan Trk B pada Gallus gallus melalui pendekatan
homologi dan mendeskripsikan penilaian struktur menggunakan software UCSF
Chimera. Hasil penelitian berdasarkan analisis in-silico diperoleh penelian struktur
tiga dimensi protein Trk A kode akses “91009” nilai QMEAN sebesar -0,80 berbentuk
?-Sheet dan Trk B kode akses “Q91987” sebesar 0,16 berbentuk ? Helix dengan 292
ikatan hydrogen. Analisis ramacahandran plot menunjukkan daerah Trk A most
favoured regions 91.5%, additional allowed regions 7.4%, generously allowed
regions 1.2%, dengan disallowed regions 0.0?n Trk B most favoured regions
92.7%, additional allowed regions 6.2%, generously allowed regions 1.2%, dengan
disallowed regions 0.0%. Identifikasi komposisi asam amino Leusin (LEU)
mendominasi daerah hydrofobik. Implementasi penelitian ini yang disusun dalam
bentuk modul layak digunakan sebagai sumber belajar dengan persentase sebesar
80,88%

Kata kunci: NT3, Pendekatan Homologi, UCSF Chimera.