SIMULASI DOCKING MOLEKULER SENYAWA TERPENOID DARI TANAMAN GENUS ALPINIA TERHADAP ENZIM INTEGRASE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS-1

ABSTRAK

Tumbuhan Genus Alpinia dilaporkan memiliki potensi sebagai anti HIV-1 dimana senyawa terpenoid 12-labdadiene-15-16-dial dari Alpinia dengan penghambat enzim integrase HIV-1. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan senyawa-senyawa dari genus Alpinia yang berpotensi sebagai inhibitor Enzim Integrase Human Immunodeficiency Virus- 1 melalui metode docking molecular. Simulasi docking dilakukan dengan menggunakan Autodock Vina yang diakses melalui Cygwin dan dilakukan Validasi berdasarkan nilai Root Mean Square Deviation (RMSD). Data struktur senyawa kimia dari tumbuhan genus Alpinia diambil dari website KnapSack dan model enzim diunduh dari situs Protein Data Bank kode 3AO2. Hasil dari penelitian diperoleh nilai RMSD yang memenuhi syarat yaitu 0.370? (< 2 ?). Terdapat 20 senyawa yang diprediksi berpotensi sebagai penghambat aktivitas Integrase HIV-1 dari genus Alpinia yaitu Alpindenoside-B (-8,9), Sumadain-C (-8,9), Isorubraine (-8,8), Galanal-B (-8,7), Pahangensin-A (-8,6), 15-Hydroxy-11-14-peroxylabda-8(17)-12-dien-1 (-8,6), Rubraine (-8,5), Ottensinin (-8,4), A-mixe-metabolite (-8,4), Zerumi-A (-8,4), Zerumi-B (-8,3), Galanal-A (-8,3), Calcaratarin-B (-8,2), Calcaratarin-A (-8,1), Apidoneside-C (-8,1), Isocoronarin-D (-8,1), Calcaratarin-D-page2 (-8,0), Hedyforrestin-B (-8,0), 2a(p-ahaydroxycinnamoy)-ci (-8,0) dan Pahangensin-C (-8,0).

Kata kunci : Alpinia, Terpenoid, Molecular Docking, Integrase HIV-1