DOCKING MOLEKULER SENYAWA BIOAKTIF UMBI ANGGREK TANAH (Geodorum Densiflorum (LAM) SCHLTR.) TERHADAP PROTEIN TARGET KANKER PAYUDARA

Kanker payudara merupakan tantangan kesehatan global dengan prevalensi yang
terus meningkat. Terapi konvensional seringkali menimbulkan efek samping berat
dan resistensi, mendorong eksplorasi senyawa bioaktif alami sebagai kandidat
antikanker alternatif. Penelitian ini bertujuan menganalisis profil fisikokimia dan
afinitas ikatan senyawa bioaktif dari umbi Geodorum densiflorum terhadap protein
target kanker payudara (ER?, PR, PDK1, Bcl-xL, dan m-TOR) melalui metode
molecular docking. Sebanyak 19 senyawa bioaktif hasil identifikasi LC-MS
dievaluasi menggunakan Lipinski Rule of Five melalui SwissADME, kemudian
dilakukan docking menggunakan AutoDock Vina 1.5.7. Validasi metode
menunjukkan nilai RMSD ?2,0 Å untuk semua protein target, mengonfirmasi
reliabilitas metode. Hasil analisis fisikokimia menunjukkan 7 senyawa (36,8%)
memenuhi kriteria Lipinski Rule of Five. Hasil molecular docking mengidentifikasi
beberapa senyawa dengan afinitas ikatan terbaik senyawa 2-(1,3-benzothiazol-2-
yl)-3-(4-oxobenzo[h]chromen-3-yl)prop-2-enenitrile menunjukkan aktivitas multitarget terhadap PDK1 (-8,2 kkal/mol), ER? (-9,8 kkal/mol), PR (-8,8 kkal/mol), dan
m-TOR (-9,0 kkal/mol); senyawa methyl 5-[(3R,4aS,7R,8R,8aS)-3,4'-dihydroxy-
4,4,7,8a-tetramethyl-6'-oxospiro [2,3,4a,5,6,7-hexahydro-1H-naphthalene-8,2'-
3,8-dihydrofuro[2,3-e]isoindole]-7'-yl]pentanoate terhadap PDK1 (-8,9 kkal/mol);
dan senyawa N-(3-aminophenyl)-4-[[4-[4-[[3- [(3-aminophenyl)carbamoyl] -2-
hydroxynaphthalen-1-yl]diazenyl] anilino]phenyl] diazenyl] -3-
hydroxynaphthalene-2-carboxamide terhadap m-TOR (-10,3 kkal/mol),
menunjukkan afinitas lebih tinggi dibanding ligan native. Analisis interaksi
molekuler menunjukkan pembentukan ikatan hidrogen dengan residu asam amino
kunci pada situs aktif protein target. Penelitian ini memberikan bukti in silico bahwa
senyawa bioaktif umbi G. densiflorum memiliki potensi sebagai kandidat inhibitor
multi-target untuk kanker payudara dan perlu divalidasi lebih lanjut melalui studi
in vitro dan in vivo.
Kata kunci: docking molekuler, Geodorum densiflorum, kanker payudara, protein
target, senyawa bioaktif